本系历经了“机械原理及机械零件教研组”、“机械学学科组”、“机械设计及理论学科组”、“设计工程系”等发展时期。隶属于本系的机械设计及理论学科为我国第一批硕士学位授予点，于1963年开始招收培养硕士研究生，并于1990年成为博士学位授予点。 本系现有在职教师15人，其中教授2人，副教授10人，长江学者特聘教授1人，国家杰出青年基金获得者1人，江苏省教学名师1人。本系在职教师已完成和正在承担国家重大基础研究计划（973）、国家863重大专项、国家自然科学基金（含重点项目）、教育部博士点基金、江苏省自然科学基金等项目近40项，企业合作项目几十项，在《Nature Nanotechnology》、《Nano Letters》、《ACS Nano》、《Physical Review Letters》、《Small》、《Applied Physics Letters》等国内外著名期刊发表SCI论文80多篇。本系教师主编出版专著、教材30多部，其中获国家级、部省级奖8部，累计发行量过百万册的教材2部，位居全国同类教材发行量第一，获国家级、部省级教学成果20多项。

工业设计系成立于2014年，现有教授、副教授3人，讲师3人，博士生导师1人，具有博士学位的老师比例100%，江苏省“六大人才高峰”1人，中国工业设计十佳教育工作者1人，中国设计业十大杰出青年1人，拥有机械工程（工业设计）二级博士点和设计学一级硕士点。近5年来，主持承担国家级及部省级项目共20余项，企业委托项目80余项，在国内核心、重点刊物上发表学术论文150余篇，EI收录60篇。出版教材专著共10本，获省部级奖10项，科研经费500万，申请和批准专利100余项，其中发明专利10余项，实用新型10项

2003年经教育部批准，东南大学机械工程学院设立工业工程本科专业，2004年9月开始招生。2005年经学校推荐、教育部备案，我校在机械工程一级学科下自主设立“制造业工业工程”二级学科，依托东南大学机械工程、管理科学与工程等一级学科博士点，具有硕士和博士学位授予权，构筑了完整的工业工程人才培养体系。 工业工程系现有专任教师15名，其中，教授5名、副教授6名、讲师4名；具有博士学位教师9名；教育部高等学校工业工程类专业教学指导委员委员1人，美国UTK客座教授1人，江苏省第十批“六大人才高峰”高层次人才1人。系还有5名以上的企业专业及高管导师。2010-2014五年中已培养出硕士、博士60名，主编参编国家级教材7本；参加和主持纵向20余项、横向15项，专利授权及受理20余项；发表SCI论文10多篇、EI论文20多篇；获得省部级奖励3项，校优秀毕业论文2篇。

中心成立于1990年，2000年批准为南京市电光源工程技术研究中心，2006年批准“新型光源技术及装备”教育部工程研究中心建设点。中心设有电光源研究室、机械设计室、自动控制研究室、光电检测实验室，现有专职研究人员23人，其中高级职称16名。中心现为中国照明协会常务理事单位，2人担任中国照明学会理事。
中心主持国家级科研攻关项目3项，承担国内外上百家企业的委托项目，项目资金超亿元，获得40多项专利授权，其中16项为发明专利。中心还获得省部委科技进步奖二、三等奖、中国10年专利金奖、中国技术市场协会金桥奖、国家推广成果优秀项目等荣誉。
中心主任：吕家东 教授级高工。骨干成员：何荣开、刘鹏、陈刚、王海鸥、张建忠、戴军、汪伟民、叶雷、张满国、尹偕、王力、邓奎刚、张建